Pokud máte jezírko dobře konstrukčně vyřešené, nemělo by dojít k poškození folie o ostrou hranu štěrku. Podobně by jste to ale měl udělat i v případě kačírku, vždyť kde je psáno, že se mezi tisíci oblými valounky nenajde jeden ostrý, který folii propíchne (podle přísloví Náhoda je b...)
Valný rozdíl v čištění kulatého nebo ostrého tvaru štěrku bych neviděl, tady myslím spíše rozhoduje frakce materiálu, a ta je víceméně volitelná u obou typů substrátu.
Spekulovat se dá o dvou otázkách - tou první je celková aktivní plocha, která asi bude u každého tvaru jiná (myšleno součet povrchů všech kamínků v jezírku) - a už jsem slyšel argumenty pro i proti.
Druhá je pak to, že u kačírku prakticky nehrozí "louhování" čehokoli do vody díky povaze materiálu, řekněme horniny (geologové prominou), ze které kačírek je. u drceného štěrku tomu tak nutně být nemusí, a řekl bych, že dost často tomu tak naopak je.
Argument zranění ryb neberte v potaz - opravdu nemá význam :)